我国以世界总种植面积50%的土地生产了全球80%以上的甘薯,产量近亿吨。复杂的遗传背景一直以来是制约甘薯研究的瓶颈,甘薯起源问题悬而未决。8月21日,上海辰山植物园(中科院上海辰山植物科学研究中心)和中国科学院上海植物生理生态研究所联合德国马克斯普朗克分子遗传研究所和分子植物生理研究所的科研团队在国际著名学术期刊《自然·植物》上共同发表了揭示甘薯起源的重要论文,绘制了甘薯基因组图谱。这是科学界在多倍体基因组学领域取得的一项重大突破,也是上海辰山植物园开园七年以来在科研领域获得的带有里程碑意义的突破,开创了多倍体复杂基因组分析的先河。
国际甘薯基因组计划始于2014年,由上海辰山植物园(中科院上海辰山植物科学研究中心)和中国科学院上海植物生理生态研究所张鹏课题组共同发起,联合德国马克斯普朗克分子遗传研究所和分子植物生理研究所共同完成。该研究充分发挥了多边合作优势,历时仅18个月,攻克了多倍体基因组组装的世界性难题。该研究采用了Illumina测序技术,自主开发了一套全新的多倍体单倍型化分析软件,成功地绘制了甘薯基因组的精细图。这为其它复杂多倍体基因组测序提供了完善可靠的策略与技术,将大力推动资源植物功能基因组学研究的进程。