宝兴网 - 国内优秀的生活资讯网站
宝兴新闻网

如何查找已知lncRNA信息?--有图有步骤

栏目:都市热点    来源:互联网新闻    作者:苏婉蓉    发布时间:2017-12-12 09:10

那么,如何在该数据库查找已知lncRNA信息?

A. 如果已有在该数据库注释的gene id或转录本id,例如,lnc-OR4F29-1,可以直接输入点击search。在source一栏有各数据库选项,可以直接选择all。

B. 如果已知该转录本序列信息,可以直接输入该序列,点击search。

(1) 搜索输入界面如下:可以直接输入 ID ,也可以输入序列。

(2) lnc-OR4F29-1,输入之后,搜索结果包括27个lncRNA转录本,我们可以看到表格给出了每个转录本的位置,正负链和长度信息。可以点击进去查看每个转录本的详细信息。也可以直接点击lncRNA gene ID查看。

(3)点击某一个转录本,如lnc-OR4F29-1:1。显示该转录本的详细信息,包括分类、来源、序列信息、物种间位点的保守性、编码潜能、有无靶向miRNA等。

总结

lncipedia 是专门研究人已知lncRNA注释信息的数据库,看到这,您可以对手里的数据进行检索,或者也可以直接下方留言直接联系我们哦~

热搜:   
ad06
如何查找已知lncRNA信息?--有图有步骤